Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC130P13994 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC130P13994 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms