Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT13P13646 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT13P13646 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT13P13646 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT13P13646 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT13P13646 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT13P13646 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT13P13646 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT13P13646 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT13P13646 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT13P13646 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT13P13646 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT13P13646 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT13P13646 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT13P13646 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT13P13646 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT13P13646 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT13P13646 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT13P13646 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT13P13646 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT13P13646 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT13P13646 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT13P13646 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT13P13646 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT13P13646 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT13P13646 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT13P13646 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms