Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL5P13501 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL5P13501 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL5P13501 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL5P13501 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL5P13501 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL5P13501 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL5P13501 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL5P13501 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL5P13501 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL5P13501 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL5P13501 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL5P13501 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL5P13501 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL5P13501 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL5P13501 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL5P13501 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL5P13501 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL5P13501 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL5P13501 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL5P13501 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL5P13501 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL5P13501 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL5P13501 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL5P13501 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL5P13501 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL5P13501 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL5P13501 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL5P13501 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCL5P13501 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL5P13501 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL5P13501 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL5P13501 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL5P13501 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL5P13501 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL5P13501 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL5P13501 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL5P13501 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL5P13501 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL5P13501 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms