Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms