Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM225BP0DP42 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms