Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD1P0DJD0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms