Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR29P0C7W0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR29P0C7W0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms