Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms