Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPIND1P05546 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPIND1P05546 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPIND1P05546 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SERPIND1P05546 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPIND1P05546 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPIND1P05546 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPIND1P05546 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPIND1P05546 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPIND1P05546 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPIND1P05546 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPIND1P05546 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPIND1P05546 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPIND1P05546 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPIND1P05546 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms