Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYCNP04198 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYCNP04198 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYCNP04198 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYCNP04198 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYCNP04198 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYCNP04198 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYCNP04198 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYCNP04198 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYCNP04198 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYCNP04198 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYCNP04198 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYCNP04198 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYCNP04198 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYCNP04198 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYCNP04198 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYCNP04198 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MYCNP04198 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYCNP04198 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYCNP04198 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYCNP04198 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYCNP04198 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYCNP04198 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYCNP04198 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYCNP04198 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYCNP04198 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYCNP04198 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYCNP04198 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYCNP04198 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MYCNP04198 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYCNP04198 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYCNP04198 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYCNP04198 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYCNP04198 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYCNP04198 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYCNP04198 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYCNP04198 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYCNP04198 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYCNP04198 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYCNP04198 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYCNP04198 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYCNP04198 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYCNP04198 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYCNP04198 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYCNP04198 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYCNP04198 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYCNP04198 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MYCNP04198 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYCNP04198 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYCNP04198 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms