Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC2P02655 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOC2P02655 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOC2P02655 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOC2P02655 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOC2P02655 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC2P02655 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC2P02655 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC2P02655 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC2P02655 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC2P02655 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC2P02655 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC2P02655 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC2P02655 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC2P02655 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC2P02655 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC2P02655 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC2P02655 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC2P02655 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC2P02655 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC2P02655 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC2P02655 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC2P02655 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC2P02655 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC2P02655 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC2P02655 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC2P02655 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOC2P02655 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC2P02655 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC2P02655 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC2P02655 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC2P02655 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC2P02655 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC2P02655 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC2P02655 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms