Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINC1P01008 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SERPINC1P01008 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINC1P01008 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms