Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTCP00480 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTCP00480 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTCP00480 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTCP00480 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTCP00480 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OTCP00480 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTCP00480 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTCP00480 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTCP00480 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTCP00480 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTCP00480 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTCP00480 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTCP00480 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTCP00480 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTCP00480 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTCP00480 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTCP00480 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTCP00480 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTCP00480 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTCP00480 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.4 ms