Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX58O95786 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX58O95786 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX58O95786 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX58O95786 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX58O95786 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX58O95786 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX58O95786 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX58O95786 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX58O95786 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX58O95786 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX58O95786 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX58O95786 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX58O95786 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX58O95786 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX58O95786 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX58O95786 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX58O95786 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX58O95786 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX58O95786 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX58O95786 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX58O95786 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX58O95786 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX58O95786 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX58O95786 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX58O95786 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX58O95786 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX58O95786 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX58O95786 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX58O95786 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX58O95786 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX58O95786 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX58O95786 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX58O95786 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX58O95786 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX58O95786 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX58O95786 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX58O95786 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX58O95786 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX58O95786 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX58O95786 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX58O95786 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX58O95786 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX58O95786 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX58O95786 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms