Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN9O95484 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN9O95484 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN9O95484 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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