Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1O95476 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms