Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH8O95206 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDH8O95206 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDH8O95206 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH8O95206 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH8O95206 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH8O95206 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH8O95206 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH8O95206 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH8O95206 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms