Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK1O94907 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK1O94907 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK1O94907 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK1O94907 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK1O94907 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK1O94907 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK1O94907 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK1O94907 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK1O94907 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DKK1O94907 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DKK1O94907 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DKK1O94907 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DKK1O94907 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DKK1O94907 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DKK1O94907 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK1O94907 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK1O94907 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK1O94907 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK1O94907 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK1O94907 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK1O94907 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK1O94907 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK1O94907 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK1O94907 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK1O94907 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK1O94907 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK1O94907 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK1O94907 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK1O94907 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms