Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms