Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNKO75909 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNKO75909 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNKO75909 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNKO75909 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCNKO75909 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCNKO75909 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNKO75909 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNKO75909 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNKO75909 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNKO75909 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNKO75909 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNKO75909 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNKO75909 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNKO75909 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNKO75909 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNKO75909 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNKO75909 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms