Protein–RNA interactions for Protein: O75674

TOM1L1, TOM1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L1O75674 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOM1L1O75674 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOM1L1O75674 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms