Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEDO75530 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEDO75530 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEDO75530 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEDO75530 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEDO75530 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEDO75530 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EEDO75530 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEDO75530 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEDO75530 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EEDO75530 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEDO75530 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEDO75530 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEDO75530 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEDO75530 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EEDO75530 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEDO75530 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEDO75530 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EEDO75530 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEDO75530 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEDO75530 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEDO75530 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EEDO75530 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEDO75530 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEDO75530 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms