Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH16O75309 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH16O75309 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH16O75309 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH16O75309 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH16O75309 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH16O75309 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH16O75309 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH16O75309 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH16O75309 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH16O75309 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH16O75309 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH16O75309 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH16O75309 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH16O75309 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH16O75309 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH16O75309 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH16O75309 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH16O75309 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH16O75309 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH16O75309 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH16O75309 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH16O75309 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH16O75309 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH16O75309 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH16O75309 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH16O75309 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH16O75309 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH16O75309 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH16O75309 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms