Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN3BO60391 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN3BO60391 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms