Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSTPIP1O43586 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms