Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB6O15197 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB6O15197 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms