Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
SYNMO15061 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNMO15061 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SYNMO15061 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYNMO15061 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYNMO15061 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYNMO15061 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYNMO15061 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNMO15061 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYNMO15061 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYNMO15061 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYNMO15061 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYNMO15061 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SYNMO15061 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNMO15061 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SYNMO15061 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SYNMO15061 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYNMO15061 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYNMO15061 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYNMO15061 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYNMO15061 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SYNMO15061 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYNMO15061 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYNMO15061 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYNMO15061 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYNMO15061 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYNMO15061 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYNMO15061 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYNMO15061 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYNMO15061 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYNMO15061 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYNMO15061 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYNMO15061 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYNMO15061 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYNMO15061 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYNMO15061 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYNMO15061 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYNMO15061 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SYNMO15061 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYNMO15061 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYNMO15061 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYNMO15061 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYNMO15061 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYNMO15061 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYNMO15061 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYNMO15061 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYNMO15061 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYNMO15061 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYNMO15061 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYNMO15061 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SYNMO15061 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms