Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLGNO14967 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLGNO14967 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLGNO14967 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLGNO14967 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLGNO14967 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLGNO14967 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLGNO14967 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLGNO14967 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLGNO14967 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLGNO14967 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLGNO14967 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLGNO14967 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLGNO14967 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLGNO14967 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLGNO14967 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLGNO14967 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLGNO14967 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms