Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC80O14777 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC80O14777 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC80O14777 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC80O14777 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC80O14777 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC80O14777 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC80O14777 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC80O14777 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC80O14777 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC80O14777 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC80O14777 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC80O14777 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC80O14777 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC80O14777 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC80O14777 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC80O14777 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC80O14777 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC80O14777 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC80O14777 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC80O14777 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC80O14777 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC80O14777 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC80O14777 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC80O14777 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC80O14777 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC80O14777 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC80O14777 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC80O14777 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC80O14777 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC80O14777 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC80O14777 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC80O14777 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC80O14777 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC80O14777 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC80O14777 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC80O14777 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC80O14777 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC80O14777 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC80O14777 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC80O14777 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC80O14777 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC80O14777 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC80O14777 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC80O14777 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC80O14777 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC80O14777 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC80O14777 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC80O14777 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC80O14777 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC80O14777 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC80O14777 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC80O14777 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC80O14777 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms