Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE40O14503 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE40O14503 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms