Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE2AO00408 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE2AO00408 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms