Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2K7ER74 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms