Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC188H7C350 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms