Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms