Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB8E9PQR5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB8E9PQR5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms