Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms