Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9IYK1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9IYK1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9IYK1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C9IYK1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C9IYK1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9IYK1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9IYK1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9IYK1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9IYK1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9IYK1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9IYK1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9IYK1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9IYK1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C9IYK1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9IYK1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9IYK1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9IYK1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C9IYK1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9IYK1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9IYK1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9IYK1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C9IYK1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9IYK1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9IYK1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9IYK1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9IYK1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms