Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DGG1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DGG1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DGG1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DGG1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DGG1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DGG1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DGG1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DGG1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DGG1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DGG1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DGG1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4DGG1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4DGG1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4DGG1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DGG1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DGG1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DGG1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DGG1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DGG1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DGG1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DGG1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DGG1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DGG1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DGG1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DGG1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DGG1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DGG1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DGG1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
B4DGG1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
B4DGG1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DGG1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DGG1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DGG1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms