Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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