Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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