Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms