Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85CA6NKD9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms