Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OTOL1A6NHN0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOL1A6NHN0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOL1A6NHN0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms