Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC144AA2RUR9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC144AA2RUR9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC144AA2RUR9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms