Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms