Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DUSP13Q9UII6 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DUSP13Q9UII6 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms