Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 RARRES3-202ENST00000354445 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLAMF8-202ENST00000368104 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A2-204ENST00000368710 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00969-204ENST00000420851 868 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00423-201ENST00000421002 903 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 YBX1P9-201ENST00000441264 679 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR141-202ENST00000447769 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC162P-207ENST00000473454 547 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008629.3-201ENST00000505786 586 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010261.2-202ENST00000506875 494 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAP30L-AS1-204ENST00000524264 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002512.1-201ENST00000525853 653 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007552.1-201ENST00000540992 927 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR11G1P-201ENST00000557042 968 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090409.1-202ENST00000586949 653 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF83-209ENST00000596930 560 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 BNIP3P36-201ENST00000603076 574 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBR3-AS1-214ENST00000624080 822 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007601.1-201ENST00000312019 1974 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 469.2 ms