Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms