Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms