Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AC090680.1-201ENST00000464696 860 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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NBR1Q14596 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 GRM4-201ENST00000374177 3590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NBR1Q14596 AL021392.1-201ENST00000426112 2949 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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